A Embrapa Acre desenvolve suas pesquisas com base nas demandas das comunidades extrativistas, agricultores, ribeirinhos, populações indígenas, pecuaristas e o público que queira agregar tecnologia ao seu processo de produção.
As pesquisas têm foco ecorregional que visam à geração de tecnologias e conhecimentos para o uso sustentável dos recursos naturais, além do planejamento territorial estratégico do estado, desenvolvimento e/ou adequação de sistemas de produção regionais, bem como à agregação de valor à produção florestal e agropecuária brasileira.
Os profissionais de pesquisa e desenvolvimento da Embrapa Acre atuam estrategicamente de forma sinérgica e colaborativa, no formato de uma rede de apoio mútuo de equipes em quatro núcleos de pesquisa:
- solos e agricultura;
- produção animal sustentável;
- produção florestal;
- fruticultura e plantas agroindustriais.